IFM学员帮助改善面包的实验​​室测试流程

在正常情况下的贝克实验室,通过欧胜研究员斯蒂芬贝克运行,是一个学术实验,在发展中国家学习传染病。不过来了冠状病毒,史蒂夫认为有必要用他的实验室的专业知识,在Addenbrooke医院提供医护人员的重要测试。

贝克实验室 tweet

虽然公共卫生英格兰已经开展测试,以检测有症状的患者的病毒,它没有能力来测试一线员工NHS。这意味着员工的症状,或谁曾接触过的人有症状,是不知道他们是否真的感染了自我隔离 SARS-CoV-2,该病毒导致covid-19。这反过来又导致了人员短缺就在Addenbrooke的是加紧应对流感大流行。

“我们不会选择做这个工作,但我们接受了挑战,”史蒂夫,他的实验室是剑桥研究所治疗​​免疫学和感染性疾病(citiid)的一部分说。但也有一些障碍需要首先克服。

聚合酶链反应(PCR)测试识别是否一个人被感染依赖于服用鼻拭子从人,分离病毒RNA,然后复制(放大)以确认该病毒的存在。然而,由于病毒是如此的传染性很强,在PCR只能在容纳3级工厂进行。这不仅放慢了进程,但同时也限制了可以做给那些现有的3级设施的可用容量测试的数量。

然而,史蒂夫的研究小组发现了一种灭活病毒鼻拭子拍摄后立即,允许更广泛地提供2级设施要处理的PCR。所述测试试剂盒通过将裂解缓冲液放入试管到其中的拭子放入制备。

“我们转向 教授伊恩·古德费洛 在病理科,”史蒂夫说。 “他能够给我们,在接触点停用病毒的缓冲材料。”

一旦准备去激活病毒程序,公共卫生英格兰(PHE)需要确认是否和失活和PCR检测是安全和准确。 PHE能够提供引物和所需的PCR探针,但他们的测试过程是在级别3的实验室不同。为了验证自己的工作,史蒂夫的实验室把棉签从医院工作人员已知covid-19感染和跑他们通过自己的PCR协议,以确保他们得到互补的结果到PHE测试。一旦他们从PHE批准他们能够开始测试医护人员。

启动和运行

凭借其新的测试能力,Addenbrooke的迅速到位的系统,工作人员可以通过推动医院的停车场,并获得鼻拭子,而不必离开自己的汽车。在这一点上,两名欧胜的学生,以帮助起草。 fathima“尼莎”卡莉达萨马德和大卫·希门尼斯科尔多瓦,无论是硕士生工业系统制造和管理(ISMM),带来了他们的制造工艺方面的知识 简化程序在收集点。他们建议采取了由医院和提高的效率和测试的经验。接下来,他们把目光转向实验室本身,看看他们是否能实际PCR检测过程中带来了类似的一种分析,以最大限度地提高效率和生产力。

“我们看发生了什么事棉签拍摄后,”大卫说。 “棉签进入其中的病毒是无效的管。该管被放入塑料自封袋,然后放置在一个生物容器。当有足够的样本,有人走过去与他们的面包师实验室“。

该实验室被分离成不同的区域来处理测试的不同方面。在里面 “肮脏的房间一队4名志愿者博士学生手动提取与移液管将样品用于RNA提取,多步骤的过程,隔离与样品中的其他生物材料的任何病毒RNA制备它们。一旦RNA是制备它被放置在一个单独的孔 PCR孔板 可同时容纳96个样品。

在一个96孔板中制备的样品中,PCR扩增可以发生在一台机器中 '整理房间。一个酶和探针的“主混合物”,其提供所述RNA的复制将原料加入到样品中。此外,每个PCR运行包含几个控制:普通水或主混合物只。 从时间样品进入实验室的最终结果需要大约4小时,并在实验室能够每天处理180奇数测试。

大卫和尼莎想知道是否有可能增加,可能在最初的步骤中提取的样本数量。 4人提取团队工作的每个成员同时历时约2小时以制备20奇数样本。可以手动移液的该步骤进出各种试剂的样本被移交给机器人自动完成提取?

转向癌症二人研究英国,谁能够有这样的自动化的机器人。但他们需要一个定制的孔板,可以容纳超过24个样品是CRUK使用。在该研究所制造回去,他们要求他们的 当然导演弗洛里安博士urmetzer如果他能帮忙。 24小时内,弗洛里安和他的同事克里斯·詹宁斯确实制造了一个定制的孔板。不幸的是,他们不能够把方法付诸实践,由于有关使用CRUK机器人样品的交叉污染问题。

“是在层流室的机器需要确保空气中不断清洗,说:”尼莎。 “所以我们不得不这些真正伟大的定制孔板但是该机不适合进入无菌柜。”

Nisha and David in the 贝克实验室

会议目标

偏向虎山行,大卫和妮莎锯另一种方式,他们可以帮助改善测试过程的能力。除了在NHS的工作人员谁是自我孤立进行的测试中,也有一个需要测试人员在某些病房工作。这些工人需要,因为他们是在与患者谁做有病毒接触频繁筛选和测试,保证工作人员使用个人防护装备工作。

“我们发现在测试中准备和分配方式的一些效率低下。是习惯了些日子不是所有的测试。其他时候,他们可能会用完。我们希望确保他们得到测试的权数给正确的人,说:”尼莎。生产规划工具目前已经通过了Addenbrooke的员工为他们的测试协议的一部分。

他们也开始对一些流程建模工作,试图理顺测试的成本。他们估计,贝克实验室费用在£39和由私人实验室进行的测试中表现出大约£10%的测试,相比于NHS测试在£100以上。然而,随着眼前的危机已经放缓,应该不再需要贝克实验室开展了NHS的工作人员测试,所以这个造型保持在初始阶段。

大卫和妮莎很高兴他们能在这段流行的NHS和贝克实验室之间的桥梁。他们觉得他们已经从过程的前后两端测试和编写一个文件,以便其他医院可以从他们的经验获得的认识。他们的志愿努力在这场危机中把自己的专业知识NHS,他们分别获得了 副校长的社会影响力奖.

两名学生将保持在欧胜,直到工作对他们的论文硕士八月底:尼莎对虚拟医疗保健咨询的新兴技术,大卫在重组供应链,公司在大流行病重新极好的装备。那么求职开始 - 假设并不需要他们的技能,以帮助与冠状病毒测试的一拨。

 

 

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